1. 乱流式(Turbulent Flow)：空气由空调机箱经风管和洁净室内的空气过滤器(HEPA)进入洁净室，并由洁净室内的回风柱或高架地板回风。气流是呈不规则的乱流或涡流状态。此型式适合于洁净室等级为：1,000-100,000级。

优点：构造简单、系统建造成本比较低，洁净室之扩充比较容易，在某些特殊用途场所需提高洁净等级，可结合洁净工作台来提高洁净室等级。

缺点：乱流造成的微尘粒子于室内空间飘浮不易排出，易污染制程产品。另外若系统停止运转再激活，欲达需求的洁净度，往往须相当长一段时间。

2.层流式(Laminar)：空气气流运动成一均匀的直线形，空气由覆盖率99.99%的高效过滤器进入室内，并由高架地板或两侧回风柱回风，此型式适合于级别比较高的洁净室，一般其洁净室等级为Class 1~100。

其型式可分为二种：

(1)水平层流式：水平式空气自过滤器单方向吹出，由对边墙壁之回风系统回风，尘埃随风向排出室外，一般在下流侧污染较严重。优点：构造简单，运转后短时间内即可变成稳定。缺点：建造费用比乱流式高，室内空间不易扩充。

(2)垂直层流式：房间天花板完全以ULPA过滤器覆盖，空气由上往下吹，可得较高之洁净度，在制程中或工作人员所产生的尘埃可快速排出室外而不会影响其它工作区域。优点：管理容易，运转开始短时间内即可达稳定状态，不易为作业状态或作业人员所影响。缺点：构造费用较高，弹性运用空间困难，天花板之吊架相当占空间，维修更换过滤器较麻烦。

3.复合式(Mixed Type)：复合式为将乱流式及层流式予以复合或并用，可提供局部超洁净之空气。(1)洁净隧道(Clean Tunnel)：以HEPA或ULPA过滤器将制程区域或工作区域99.99%覆盖使洁净度等级提高至10级以上。